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CRISPR文库筛选

一、全程DIY一质粒方案

现货文库质粒低至890 (100ug 细胞转染级别)

addgene进口,来源可溯

货期: 2周

现货文库明细
货号名称
HL108人脂滴和代谢文库
HL114人表观遗传基因CRISPR敲除文库
HL113人代谢基因CRISPR敲除文库
HL107人泛素化相关蛋白CRISPR敲除文库
HL106人干扰素刺激基因CRISPR敲除文库
HL109A人激酶CRISPR敲除文库
HL109B人激酶CRISPR敲除文库
HL105人激酶结构域聚焦CRISPR敲除文库
HL102A人类CRISPR基因敲除文库A库
HL102B人类CRISPR基因敲除文库B库
HL103人类CRISPR激活文库
HL115人类药物库
HL111人膜蛋白CRISPR敲除文库
HL104人膜蛋白激活文库
HL110人药物靶点、激酶、磷酸酶CRISPR敲除文库
HL112人运输、线粒体、运动性CRISPR敲除文库
ML101A小鼠CRISPR基因敲除文库A库
ML101B小鼠CRISPR基因敲除文库B库
ML102小鼠CRISPR激活文库
ML107小鼠代谢基因CRISPR敲除文库
ML103小鼠代谢文库
ML108小鼠激酶CRISPR敲除文库
ML105A小鼠膜蛋白CRISPR敲除文库
ML105B小鼠膜蛋白CRISPR敲除文库
ML110小鼠膜蛋白激活文库(CRISPRa)
ML109小鼠膜蛋白抑制文库(CRISPRi)
ML104A小鼠药物靶点、激酶、磷酸酶CRISPR敲除文库
ML104B小鼠药物靶点、激酶、磷酸酶CRISPR敲除文库
ML106A小鼠转运、线粒体、运动基因CRISPR敲除文库
ML106B小鼠转运、线粒体、运动基因CRISPR敲除文库


二、超高性价比一病毒方案

文库病毒包装: 5980元/1mL病毒

滴度: 1E+08 TU/mL

适用范围:全基因组敲除文库A库或A+B库

2-3周交付


三、文库细胞株

300×覆盖度;NGS检测覆盖度>90%

文库细胞株低至9800

交付: 10^6~10^7 Cells


四、文库定制  

1K文库低至18880

6K文库低至28880

4-8周交付,交付100 ug质粒


2025技术服务活动-20250207.jpg


CRISPR-gRNA文库是高通量筛选靶基因的重要工具,可用于大规模或全基因组功能筛选,涉及信号通路、疾病、细胞药物应答、发育、基因调控等方面。海星生物在gRNA文库筛选方面拥有丰富的经验,能够帮助客户快速构建CRISPR KO(基因敲除)、CRISPRa(基因激活)文库CRISPRi(基因抑制/沉默),也可以为客户提供全套的细胞功能筛选服务,涵括文库构建、病毒文库、细胞转染和筛选、NGS测序与数据分析服务。


CRISPR文库筛选的常规流程

文库构建、病毒文库、细胞测试

500+成功“高分”细胞株,请致电400-990-6627 / 18626127718(微信同号)咨询。

服务类型介绍

文库构建、病毒文库、细胞测试

*海星生物提供现货供应,针对Human和Mouse全基因组范围的基因敲除(CRISPR KO)gRNA文库,实现全基因范围内功能基因的高通量快速筛选。

*海星生物还可以按照需求为客户设计合成靶向特定通路或者基因的gRNA订制文库。



案例分析

Nature Genetics,A genome-wide CRISPR screen identifies a restricted set of HIV host dependency factors

美怀特海德研究所、拉根研究所和布罗德研究所的研究人员利用CRISPR-Cas9基因编辑技术找出三个有望用于治疗HIV感染的新靶标。

研究者利用CRISPR敲除筛选的策略,将影响HIV感染,同时又是细胞存活非必需的基因。一共找出5个基因,其中它三个在早前的利用RNA干扰(RNAi)的研究中并未被鉴定。

作者描述:我们的研究HIV感染的主要靶标,并找出在病毒对T细胞的感染中起着最为显著性作用的宿主基因。之前的研究已找出几种宿主依赖性因子,包括HIV侵入CD4阳性T细胞所需的两种蛋白:CD4分子、CCR5,唯一被认为治愈HIV感染的一个人就是接受来自携带这种CCR5突变的供者的骨髓移植。2008年的三项利用RNAi鉴定潜在的宿主依赖性因子的研究鉴定出800多种可能的靶标;但是这些结果很少存在重叠,提示着存在较高的假阳性。

原因是:RNAi抑制但不会完全阻断基因表达,这可能允许靶基因产生足够多的蛋白来允许HIV感染,而且它也能够抑制靶基因之外的其他基因表达,从而导致假阳性结果。利用CRISPR对源自HIV敏感性的CD4阳性T细胞的一种细胞系进行筛选,研究人员鉴定出5个基因:当让它们失活时,会让细胞免受HIV感染,同时不会影响细胞存活。


文库构建、病毒文库、细胞测试


A pooled, genome-wide CRISPR screen for HIV HDFs. (a) Outline of the genome-wide CRISPR screen strategy. WT, wild type; KO, knockout. (b) Flow cytometry analysis (representative of five independent experiments) of cells infected with the HIV-1 strain JR-CSF and expressing GFP as a reporter of productive HIV infection. Where indicated, cells were transduced with sgCCR5 or an sgRNA that does not target protein-coding sequences
in the human genome (nontargeting control). (c) Flow cytometry analysis (representative of three independent experiments) quantifying CD4 and CCR5 expression on the surface of wild-type GXRCas9 cells and GXRCas9 cells that were transduced with the genome-wide sgRNA library and serially infected with HIV-1 strain JR-CSF. (d) Log2-transformed fold change in the abundance of the fifth most enriched sgRNA for every gene following HIV infection. See also supplementary Figure 1 and supplementary table 1. (e) Enrichment of individual sgRNAs for three candidate HDFs and two control genes. Values indicate log2-transformed fold change in abundance following HIV infection. Values for the uninfected group are from GXRCas9 cells that were transduced with the genome-wide sgRNA library and cultured for 3 weeks.


Cas9X 海星生物可以为病毒感染筛选相关的靶向基因提供:全基因组的gRNA病毒、细胞株的构建、验证细胞株的敲除等成熟的技术支撑。

CRISPR基因编辑技术原理

CRISPR基因编辑技术原理.png

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Wu W, Pu Y, Gao S, et al. Bacterial Metabolism-Initiated Nanocatalytic Tumor Immunotherapy[J]. Nano-Micro Letters, 2022, 14(1): 1-21.


2. Cas9X®基因编辑服务:影响因子为17.694

Bu, J., Zhang, Y., Wu, S. et al. KK-LC-1 as a therapeutic target to eliminate ALDH+ stem cells in triple negative breast cancer. Nat Commun 14, 2602 (2023).


3. Cas9X®基因编辑服务:影响因子为8.322

Li W, Ali T, Zheng C, et al. Fluoxetine regulates eEF2 activity (phosphorylation) via HDAC1 inhibitory mechanism in an LPS-induced mouse model of depression[J]. Journal of neuroinflammation, 2021, 18(1): 1-19.


4. Cas9X®基因编辑服务:影响因子为15.992

Li W, Ali T, Zheng C, et al. Anti-depressive-like behaviors of APN KO mice involve Trkb/BDNF signaling related neuroinflammatory changes[J]. Molecular Psychiatry, 2022, 27(2): 1047-1058.


5. Cas9X®基因编辑服务:影响因子为38.12

Ma B, Ju A, Zhang S, et al. Albumosomes formed by cytoplasmic pre-folding albumin maintain mitochondrial homeostasis and inhibit nonalcoholic fatty liver disease[J]. Signal Transduction and Targeted Therapy, 2023, 8(1): 229.

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