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标准化流程,确保文库多样性>95%和均匀覆盖。步骤如下: 1. 文库设计:根据您的靶基因列表(单基因或全基因组),使用算法优化sgRNA序列(每基因4-10个sgRNA)。 2. 寡核苷酸合成:合成高纯度寡核苷酸池,包含U6启动子驱动的sgRNA。 3. 载体克隆:将寡核苷酸池克隆入慢病毒载体(如lentiCRISPR v2),转化E. coli产生质粒库。 4. 细胞转导:使用慢病毒转导目标细胞系(如HEK293或原代细胞),MOI=0.3控制覆盖率。 5. 验证与扩增:NGS测序验证文库完整性,扩增至10^8-10^9细胞规模。 输出:冻存细胞文库 + 验证报告。 基于您的需要的小鼠模型,构建可靠的体内筛选平台,确保移植成功率>90%。步骤如下: 1. 动物准备:选择对应小鼠(如B6、NSG)不同的处理以适应移植。 2. 细胞移植:静脉或皮下注射文库细胞(1-5×10^6细胞/侧),分组设置对照(非靶向sgRNA)。 3. 模型监测:跟踪肿瘤生长曲线或疾病进展,持续2-6周。 4. 组织收获:解剖收集目标组织(如肿瘤),分离富集细胞或者直接裂解。 5. 下游分析:NGS定量sgRNA丰度,鉴定富集/耗竭基因。 输出:筛选数据 + 打分基因列表 + 动物模型报告。
针对体内直接递送研究,海星提供AAV病毒文库定制,支持肝脏、脑或肌肉靶向。步骤如下: 1. 载体设计:整合sgRNA文库至AAV骨架(如AAV2/8血清型),优化ITR和启动子。 2. 病毒包装:瞬时转染HEK293细胞,HEK293T辅助包装产生高滴度病毒(>10^12 vg/mL)。 3. 纯化与滴度:密度梯度超速离心纯化,qPCR测定病毒滴度。 4. 质量控制:空壳率<10%、NGS验证文库完整性,无内毒素污染,符合注射标准。 输出:AAV病毒文库 + 滴度证书 + 序列验证报告。 |
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【2025-2026】文库体内筛选应用指南
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